一、历任校长
1.  孙家鼐（1898年7月—1900年春）
2.  许景澄（1900年春—1900年8月）
3.  张百熙（1902年1月—1904年1月）
4.  张亨嘉（1904年1月—1906年2月）
5.  李家驹（1906年3月—1907年8月）
6.  朱益藩（1907年8月—1908年1月）
7.  刘廷琛（1908年1月—1911年12月）
8.  柯劭愍（1910年12月—1911年12月）
9.  劳乃宣（1911年12月—1912年2月）
10. 严复　（1912年2月—1912年10月）
11. 章士钊（1912年10月—1912年12月）
12. 何燮侯（1912年12月—1913年11月）
13. 胡仁源（1913年11月—1916年12月）
14. 蔡元培（1916年12月—1927年7月）
15. 刘哲　（1927年8月—1928年6月）
16. 李煜嬴（1928年6月—1929年1月）
17. 陈大齐（1929年1月—1929年8月）
18. 蔡元培（1929年9月—1930年12月）
19. 蒋梦麟（1930年12月—1945年10月）
20. 胡适　（1945年10月—1948年12月）
21. 汤用彤（1949年5月—1951年9月）
22. 马寅初（1951年9月—1960年3月）
23. 陆平　（1957年10月—1966年5月）
24. 周培源（1978年7月—1981年3月）
25. 张龙翔（1981年6月—1984年3月）
26. 丁石孙（1984年3月—1989年8月）
27. 吴树青（1989年8月—1996年8月）
28. 陈佳洱（1996年7月—1999年12月）
29. 许智宏（1999年12月—）